Секретариат проекта ФОР создан для выполнения повседневной реализации и управления проектом: координации и участие в обзоре коллег; оценки достоверности сообщаемых данных для обеспечения точности и уменьшения вероятности искажения данных; организации и участия в контр-верификациях на полугодовой основе; управление финансами проекта; закупки в рамках проекта; проведение фидуциарного аудита для поставщиков услуг и услуги секретариата для НРК и технической команды ФОР
Секретариат ФОР состоит из консультантов различных профессиональных направлений, в том числе медицина, финансирование/экономика здравоохранения, информационные технологии, управление, мониторинг и оценка/управления данными, бухгалтерский учет и отчетность, управление контрактами и административная/материально-техническая поддержка.